Polemik seputar mutasi di tubuh TNI menjadi sorotan setelah pergantian Letjen TNI Kunto Arief Wibowo dari jabatannya sebagai Panglima Komando Gabungan Wilayah Pertahanan I (Pangkogabwilhan I) mencuat. Pergantian ini awalnya diumumkan akan dilakukan dengan Laksda TNI Hersan sebagai penggantinya, namun berubah sehari kemudian. Hal ini menimbulkan kebingungan di kalangan publik dan politikus terkenal seperti Amien Rais, yang mengkritik langkah Panglima TNI Jenderal Agus Subiyanto sebagai tidak profesional.
Amien Rais menyoroti kebijakan mutasi tersebut dan memberikan dukungan penuh kepada Letjen Kunto, bahkan menyebutnya layak untuk menjadi calon presiden pada Pemilu 2029. Di samping itu, Amien juga menyoroti dinamika keputusan mutasi yang ditangguhkan, menekankan agar lembaga negara, termasuk TNI, tidak terlibat dalam praktik curang atau sogokan dalam pengambilan keputusan penting.
Meskipun alasan mutasi didasarkan pada kebutuhan organisasi, tidak ada unsur politik atau pribadi yang terlibat, Amien Rais tetap merasa ada kejanggalan dalam proses tersebut. Dalam pandangannya, penghapusan presidential threshold 20 persen untuk Pilpres 2029 akan membuka peluang bagi tokoh-tokoh potensial seperti Letjen Kunto. Amien juga mengingatkan bahwa latar belakang militer bukanlah hambatan untuk memimpin negara dengan sukses, seperti yang pernah ditunjukkan oleh Presiden Susilo Bambang Yudhoyono.
